Kusabab Tomat Brown Rugose Fruit Virus nginféksi pepelakan tomat sareng cabé di sakumna dunya, perusahaan siki ngusahakeun beternak tomat tahan.
Sumber daya genetik sareng génomik anu beunghar sayogi pikeun peternak tomat bahkan sateuacan ngamimitian proyék sequencing génomik tomat. Kumpulan plasma nutfah tomat badag geus lila diadegkeun di sababaraha lokasi. Langkung ti 75,000 aksési tomat disimpen di bank gen di sakumna dunya. Salah sahiji anu panggedéna nyaéta bank gen USDA di Geneva, NY.
Sequencing génom tomat ieu diprakarsai dina 2005 salaku usaha multinasional antara 14 nagara jeung réngsé dina 2012. Usaha ieu geus greatly gancangan jeung aplikasi kecerdasan jieunan, mesin learning jeung algoritma canggih pikeun nganalisis jumlah badag data genetik jeung phenotypic.
Tomat Pan-Génom
Panaliti ti Boyce Thompson Institute di 2020 nyiptakeun génom rujukan kualitas luhur pikeun tomat liar pikeun ngahasilkeun pan-génome tomat anu langkung lengkep sareng mangpaat. Aranjeunna mendakan bagian génom anu ngadasarkeun rasa buah, ukuran sareng ripening, kasabaran setrés sareng résistansi panyakit. Hatur nuhun kana téknologi sequencing anu canggih anu tiasa maca potongan DNA anu panjang pisan, génom rujukan langkung lengkep sareng akurat tibatan database anu aya.
Téknologi sequencing heubeul nu maca potongan pondok DNA ngaidentipikasi mutasi dina tingkat basa tunggal. Tapi, aranjeunna henteu saé pikeun milarian varian struktural sapertos sisipan, ngahapus, ngabalikeun atanapi duplikasi sakumpulan DNA anu ageung.
Taun 2019, grup panaliti internasional ngawangun pan-génome tomat nganggo sekuen génom tina 725 variétas filogénétik sareng géografis. database ieu ngawengku 4,873 gén teu kapanggih dina génom rujukan aslina. Analisis variasi hadir/henteu ngungkabkeun leungitna gén anu ageung sareng seleksi négatif gén sareng promotor salami doméstikasi sareng perbaikan tomat.
Baca artikel lengkep dina www.seedworld.com.